44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1780 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1780  FMN-binding domain protein  100 
 
 
127 aa  249  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  48.11 
 
 
657 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.71 
 
 
640 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  35.43 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  34.71 
 
 
591 aa  64.7  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3251  FMN-binding domain protein  53.42 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.963687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3180  FMN-binding domain protein  42.42 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.321084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1030  FMN-binding domain protein  46.43 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.7 
 
 
628 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0796  FMN-binding domain protein  42.86 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.71 
 
 
597 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  32.52 
 
 
517 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  37.62 
 
 
715 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  36 
 
 
576 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3782  FMN-binding domain protein  46.58 
 
 
715 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.59 
 
 
582 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  34.88 
 
 
608 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.25 
 
 
603 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.45 
 
 
650 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.59 
 
 
582 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  34.21 
 
 
631 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  36.59 
 
 
582 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  36.59 
 
 
582 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  35.37 
 
 
582 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  36.47 
 
 
702 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0137  FMN-binding domain protein  44.44 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  34.15 
 
 
586 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2279  FMN-binding domain-containing protein  25.89 
 
 
448 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.399623  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  31.58 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  33.59 
 
 
609 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  31.71 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  30.91 
 
 
637 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.93 
 
 
586 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2091  FMN-binding domain-containing protein  25 
 
 
447 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.857142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  31.82 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  31.51 
 
 
603 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  32.53 
 
 
1004 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  34.67 
 
 
605 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.56 
 
 
957 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.65 
 
 
577 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.73 
 
 
599 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3725  FMN-binding domain protein  37.5 
 
 
190 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3923  FMN-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>