23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2091 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1419  hypothetical protein  72.52 
 
 
450 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2091  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  928    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.857142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1972  FMN-binding domain-containing protein  76.85 
 
 
449 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2279  FMN-binding domain-containing protein  77.27 
 
 
448 aa  721    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.399623  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  32.17 
 
 
126 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  34.15 
 
 
118 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  30.84 
 
 
120 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  39.24 
 
 
598 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  33.75 
 
 
118 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  28.16 
 
 
725 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.93 
 
 
580 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  28.57 
 
 
138 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.77 
 
 
584 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  27.08 
 
 
517 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  26.36 
 
 
582 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.13 
 
 
582 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  30.84 
 
 
586 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.13 
 
 
582 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  31.03 
 
 
123 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  25.73 
 
 
657 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  31.18 
 
 
586 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  28.92 
 
 
1005 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1780  FMN-binding domain protein  25 
 
 
127 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>