23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1972 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1419  hypothetical protein  74.43 
 
 		 450 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2091  FMN-binding domain-containing protein  76.85 
 
 		 447 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.857142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1972  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  931    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2279  FMN-binding domain-containing protein  74.27 
 
 		 448 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.399623  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  32.14 
 
 		 118 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  32.97 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.69 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  30.37 
 
 		 138 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  31.13 
 
 		 725 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  36.27 
 
 		 126 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  32.11 
 
 		 120 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  36.71 
 
 		 598 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  37.17 
 
 		 702 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  29.35 
 
 		 1005 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  36.25 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  22.99 
 
 		 657 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  34.91 
 
 		 608 aa  47  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  38.03 
 
 		 599 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  28.26 
 
 		 715 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.03 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.06 
 
 		 616 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.65 
 
 		 169 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0137  FMN-binding domain protein  38.46 
 
 		 127 aa  43.1  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>