36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2117 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
169 aa  323  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  47.41 
 
 
725 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.05 
 
 
580 aa  70.9  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  35.04 
 
 
120 aa  63.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.68 
 
 
368 aa  61.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  34.58 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  44.74 
 
 
598 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  39.78 
 
 
702 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  38.46 
 
 
608 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  32.67 
 
 
118 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  42.5 
 
 
599 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  36.89 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1419  hypothetical protein  31.65 
 
 
450 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  39.02 
 
 
609 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  48.72 
 
 
120 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04000  FMN-binding domain protein  27.27 
 
 
127 aa  47.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000143856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  34.12 
 
 
626 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  28.83 
 
 
603 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.91 
 
 
577 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  29.23 
 
 
576 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  35 
 
 
138 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1972  FMN-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
449 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0617  FMN-binding domain-containing protein  43.64 
 
 
97 aa  44.7  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2602  FMN-binding domain protein  37.04 
 
 
181 aa  44.3  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  38.55 
 
 
586 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0303  FMN-binding domain protein  32.04 
 
 
118 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.340039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  36.26 
 
 
517 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  30.97 
 
 
623 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  29.66 
 
 
123 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  35 
 
 
715 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1080  hypothetical protein  53.66 
 
 
299 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.361626  normal  0.0759114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  36.14 
 
 
586 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2279  FMN-binding domain-containing protein  29.87 
 
 
448 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.399623  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24380  hypothetical protein  33.63 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  32.32 
 
 
1004 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.33 
 
 
1005 aa  40.8  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>