More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0025 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 517 aa  1051    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  30.55 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.85 
 
 		 427 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.79 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  29.64 
 
 		 360 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 375 aa  114  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  27.7 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 375 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  25 
 
 		 373 aa  106  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  28.05 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  28.42 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.42 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.42 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  23.04 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 368 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 364 aa  98.2  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  26.24 
 
 		 363 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.61 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 386 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 409 aa  91.7  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 383 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 383 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  31.27 
 
 		 358 aa  88.2  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  36.81 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.24 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  22.91 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  29.1 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  43.18 
 
 		 1005 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  29.48 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.95 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  42.72 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  23.76 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  28.02 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.09 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.4 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  28 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.09 
 
 		 628 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 390 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 354 aa  72  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  37.76 
 
 		 1004 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.91 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.69 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  24.54 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  24.06 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  27 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  32.69 
 
 		 603 aa  67  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  23.03 
 
 		 409 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  28.46 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  21.9 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.05 
 
 		 580 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  30.23 
 
 		 138 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  21.94 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  34.13 
 
 		 591 aa  64.7  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  44.05 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  23.05 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>