51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2682 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  100 
 
 
725 aa  1427    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2006  FMN-binding domain protein  59.05 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600004  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1080  hypothetical protein  41.86 
 
 
299 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.361626  normal  0.0759114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18790  FMN-binding domain protein  37.04 
 
 
251 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  47.41 
 
 
169 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  51.55 
 
 
580 aa  79.7  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  51.85 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  40 
 
 
118 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  37.4 
 
 
120 aa  68.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  48.68 
 
 
598 aa  69.3  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  38.98 
 
 
123 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  36.7 
 
 
118 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1419  hypothetical protein  33.96 
 
 
450 aa  61.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  36.45 
 
 
120 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04000  FMN-binding domain protein  32.76 
 
 
127 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000143856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  31.43 
 
 
597 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  40.86 
 
 
702 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  36.36 
 
 
623 aa  58.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2279  FMN-binding domain-containing protein  41.56 
 
 
448 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.399623  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 
175 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  35.25 
 
 
126 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  38.54 
 
 
948 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  33.61 
 
 
517 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  29.21 
 
 
292 aa  54.3  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  29.14 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  30.2 
 
 
450 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.89 
 
 
577 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1972  FMN-binding domain-containing protein  30.83 
 
 
449 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  31.9 
 
 
599 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14850  hypothetical protein  27.75 
 
 
228 aa  52.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000151684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2091  FMN-binding domain-containing protein  29.31 
 
 
447 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.857142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  36.78 
 
 
715 aa  51.6  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  32.52 
 
 
591 aa  51.2  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  30.77 
 
 
586 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  35.16 
 
 
138 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  34.74 
 
 
1004 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0617  FMN-binding domain-containing protein  39.34 
 
 
97 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2602  FMN-binding domain protein  44.44 
 
 
181 aa  48.5  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  31.78 
 
 
576 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  35.96 
 
 
1005 aa  48.5  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.15 
 
 
609 aa  48.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  35.16 
 
 
608 aa  48.1  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  28.18 
 
 
763 aa  46.6  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.09 
 
 
478 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1394  FMN-binding domain protein  31.4 
 
 
165 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.99 
 
 
616 aa  45.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  27.88 
 
 
586 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.46 
 
 
483 aa  44.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  41.54 
 
 
605 aa  44.3  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  25 
 
 
521 aa  44.3  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.33 
 
 
603 aa  43.9  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>