12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2006 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2006  FMN-binding domain protein  100 
 
 
484 aa  967    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600004  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  59.27 
 
 
725 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1080  hypothetical protein  42.91 
 
 
299 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.361626  normal  0.0759114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18790  FMN-binding domain protein  39.25 
 
 
251 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.36 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14850  hypothetical protein  32.65 
 
 
228 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000151684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  26.29 
 
 
715 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1394  FMN-binding domain protein  35.96 
 
 
197 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.14 
 
 
368 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  29.93 
 
 
123 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2490  putative lipoprotein  30.6 
 
 
147 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  34.23 
 
 
926 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>