More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1644 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 		 483 aa  987    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  64.88 
 
 		 478 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  41.03 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  39.47 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  36.34 
 
 		 359 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  34.08 
 
 		 338 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  35.58 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  35.09 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  36.08 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  31.96 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 354 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  35.49 
 
 		 354 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  30.75 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.63 
 
 		 307 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  32.61 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  31.95 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  50.62 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  66.67 
 
 		 175 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  32.46 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  53.24 
 
 		 298 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  30.37 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 315 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  30.45 
 
 		 318 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  46.76 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  33.56 
 
 		 289 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 318 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  34.38 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  56.64 
 
 		 216 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 309 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 354 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 317 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.21 
 
 		 907 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  54.55 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  30.24 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 293 aa  123  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  53.57 
 
 		 113 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.23 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.04 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.76 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  33.46 
 
 		 312 aa  120  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  29.01 
 
 		 517 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  30.94 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  30.26 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  40.27 
 
 		 259 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  30.54 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  30.58 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  34.08 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 322 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 		 418 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  32.43 
 
 		 276 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.49 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  28.05 
 
 		 291 aa  114  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 350 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 350 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  42.03 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.2 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.2 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  29.54 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  30.4 
 
 		 305 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.43 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.43 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.2 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.77 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  49 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  32.99 
 
 		 948 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  27.19 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  46.4 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 288 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 311 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 313 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  31.45 
 
 		 323 aa  107  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>