More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1540 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  100 
 
 
323 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  76.58 
 
 
296 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  77.44 
 
 
296 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  70.59 
 
 
288 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  72.35 
 
 
291 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  73.13 
 
 
311 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  64.91 
 
 
299 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  62.22 
 
 
289 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  63.06 
 
 
292 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  56.65 
 
 
303 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  54.92 
 
 
314 aa  275  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  55.6 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  47.04 
 
 
312 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  38.93 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  35.88 
 
 
291 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  37.55 
 
 
289 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  38.46 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  29.15 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  28.31 
 
 
318 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  33.09 
 
 
341 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.83 
 
 
300 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  32.6 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  33.57 
 
 
321 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  31.41 
 
 
303 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  30.66 
 
 
318 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  31.21 
 
 
312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  31.54 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  26.62 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  31.51 
 
 
313 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  30.18 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.54 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
318 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  31.97 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  33.21 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  31.02 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
318 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
379 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  31.73 
 
 
308 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  32.09 
 
 
404 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  31.91 
 
 
276 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  32.73 
 
 
317 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
297 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.45 
 
 
483 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.3 
 
 
322 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  31.43 
 
 
312 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
321 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  33.21 
 
 
382 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  27.4 
 
 
363 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.96 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  29.75 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  27.68 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  29.04 
 
 
338 aa  99  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  29.04 
 
 
338 aa  99  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.64 
 
 
304 aa  99  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  28.52 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  30.99 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  30.74 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  35.46 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  27.3 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.26 
 
 
305 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.88 
 
 
351 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  30.11 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8855  periplasmic binding protein  30.35 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.461733  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  28.46 
 
 
312 aa  93.6  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
354 aa  92.8  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.37 
 
 
356 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.94 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 
478 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2498  periplasmic binding protein  30.1 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904872  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
303 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  34.92 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  36.98 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  27.73 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  27.9 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.09 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  31 
 
 
517 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  35.52 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  25.39 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  29.82 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  29.82 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  29.82 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  29.82 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  29.82 
 
 
332 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  28.77 
 
 
284 aa  89  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
300 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>