More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0867 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  100 
 
 
297 aa  588  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  97.98 
 
 
299 aa  578  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  48.29 
 
 
293 aa  298  9e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  53.24 
 
 
296 aa  297  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  44.17 
 
 
292 aa  241  7.999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  36.97 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.16 
 
 
307 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  31.93 
 
 
363 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  32.85 
 
 
354 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  33.81 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  32.51 
 
 
300 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  32.49 
 
 
315 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  30.87 
 
 
309 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  32.63 
 
 
318 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  31.77 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  33.92 
 
 
318 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  28.52 
 
 
338 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  28.67 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  28.67 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.94 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.01 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.43 
 
 
335 aa  122  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  29.79 
 
 
322 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  30.58 
 
 
483 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  31.01 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  30.72 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  29.04 
 
 
321 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.03 
 
 
356 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  29.48 
 
 
318 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  26.64 
 
 
300 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  29.18 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.5 
 
 
313 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
304 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  31.06 
 
 
345 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  27.11 
 
 
296 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  28.77 
 
 
297 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  26.98 
 
 
517 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.08 
 
 
478 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
293 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.18 
 
 
317 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
318 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
334 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  28.92 
 
 
274 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  24.04 
 
 
318 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  28.92 
 
 
274 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
311 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.47 
 
 
315 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.12 
 
 
287 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
300 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  27.34 
 
 
276 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.18 
 
 
315 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.32 
 
 
254 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.18 
 
 
315 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  27.37 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  26.69 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  24.91 
 
 
339 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.82 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.82 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.82 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.82 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  28.18 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.77 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  34.66 
 
 
723 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  28.06 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  29.11 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  26.53 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  28.17 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
377 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.44 
 
 
309 aa  95.9  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  32.16 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  29.12 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  34.3 
 
 
723 aa  95.5  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  24.04 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  24.75 
 
 
303 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  25.29 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.22 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  23.22 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  30.03 
 
 
289 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  27.56 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.22 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
289 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.22 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  27.7 
 
 
300 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  30.15 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  27.85 
 
 
429 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  23.22 
 
 
332 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.22 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>