More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4216 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  100 
 
 
315 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  93.02 
 
 
315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  93.02 
 
 
315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  92.06 
 
 
315 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  92.06 
 
 
315 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  92.06 
 
 
315 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  90.16 
 
 
315 aa  594  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  90.79 
 
 
315 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  91.75 
 
 
315 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  90.85 
 
 
317 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4673  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.13 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4374  periplasmic binding protein  28.75 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.99 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4280  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.75 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0936488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0582  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.75 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.818084  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4655  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.66 
 
 
293 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4441  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.75 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4291  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.75 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4786  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.75 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4660  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.8 
 
 
293 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1214  periplasmic binding protein  31.68 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0039818  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1192  periplasmic binding protein  31.68 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.842601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0212  putative ferrichrome ABC transporter periplasmic-binding protein  27.85 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0213  putative iron chelate uptake ABC transporter, solute-binding protein  27.53 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.77 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  28.42 
 
 
299 aa  95.5  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  25.45 
 
 
335 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.84 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2356  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  25.57 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  27.4 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3454  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0575769  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  26.84 
 
 
313 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  27.94 
 
 
330 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  27.94 
 
 
330 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
318 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.76 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.83 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  28.89 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  25.3 
 
 
682 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  23.89 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  23.4 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1764  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.56 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  24.35 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.06 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  24.03 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  23.18 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  25 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  27.58 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  27.58 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  23.53 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.33 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  28.78 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.33 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.74 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  25.08 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  23.12 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  24.13 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1790  periplasmic-binding protein  28.9 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.1 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  26 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  23.62 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  23.44 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  23.53 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  23.2 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  22.73 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  24.84 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  23.94 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.22 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  25.22 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.3 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.15 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  24.39 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.61 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.3 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  21.03 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.7 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55000  ABC transporter periplasmic protein  22.26 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300929  unclonable  2.23154e-21 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.48 
 
 
377 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  26.56 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  23.61 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>