More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2078 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  100 
 
 		 335 aa  685    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2392  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 390 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.191932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.58 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.58 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.58 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.58 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.58 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.27 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.34 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0212  putative ferrichrome ABC transporter periplasmic-binding protein  25.31 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0213  putative iron chelate uptake ABC transporter, solute-binding protein  25.31 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 293 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  27.27 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.72 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.37 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  25.87 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 296 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1764  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  24.06 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.55 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  25.55 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.55 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  23.78 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.03 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4673  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.97 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.9 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  27.8 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  24.16 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1180  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  25.13 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000254745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4280  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.9 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0936488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0582  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.35 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.818084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.77 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.9 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.46 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  23.74 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.55 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  23.47 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  26.09 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4655  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.97 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3557  putative periplasmic substrate-binding protein  29.28 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00679911  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  27.83 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  23.72 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.22 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  23.72 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  23.72 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  23.64 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>