More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2494 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  100 
 
 
406 aa  802    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  39.5 
 
 
377 aa  249  9e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  41.78 
 
 
391 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0880  corrinoid ABC transporter substrate-binding protein  41.22 
 
 
385 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  40.36 
 
 
360 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  39.18 
 
 
400 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  27.96 
 
 
318 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  33.45 
 
 
307 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  30.87 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  33.7 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
318 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  29.04 
 
 
289 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
315 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  25.36 
 
 
339 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
318 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  31.83 
 
 
308 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
315 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  28.85 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  29.25 
 
 
328 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  30.19 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
300 aa  109  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  29.18 
 
 
338 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  29.18 
 
 
338 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  29.79 
 
 
322 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.93 
 
 
338 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
291 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
337 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
354 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  30.92 
 
 
314 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  29.35 
 
 
363 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.86 
 
 
305 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
351 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
289 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  26.5 
 
 
305 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
321 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  31.6 
 
 
333 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28 
 
 
335 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25.73 
 
 
331 aa  101  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  24.17 
 
 
333 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  28.93 
 
 
312 aa  99.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  29.54 
 
 
352 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  28.32 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
404 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  29.2 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.2 
 
 
309 aa  94  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  30.45 
 
 
292 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  28.01 
 
 
299 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  27.48 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  25.78 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
311 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  29.51 
 
 
303 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  26.34 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.01 
 
 
297 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  28.15 
 
 
288 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  26.81 
 
 
312 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
299 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  28.67 
 
 
517 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  28.88 
 
 
287 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  26.71 
 
 
291 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  23.68 
 
 
295 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25 
 
 
311 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  30.88 
 
 
304 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  26.79 
 
 
321 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.96 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.76 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.81 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  30.53 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  30.88 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
296 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.68 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.68 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.68 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  24.91 
 
 
293 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  23.6 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.68 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  28.73 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.64 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  26.41 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.27 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.64 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  27.9 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.05 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  29.06 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  30.26 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  25.46 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  27.65 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  29.47 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  26.49 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  23.4 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  22.71 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>