More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0296 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  100 
 
 
315 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  96.51 
 
 
315 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  39.49 
 
 
318 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  41.85 
 
 
318 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  40.43 
 
 
318 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  38.93 
 
 
339 aa  221  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  40.65 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  38.63 
 
 
335 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  39.13 
 
 
318 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  39.27 
 
 
354 aa  202  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  37.98 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  38.65 
 
 
322 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  36.34 
 
 
341 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  37.55 
 
 
331 aa  196  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  38.54 
 
 
337 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  38.54 
 
 
338 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  38.54 
 
 
338 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  38.49 
 
 
351 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  36.88 
 
 
338 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  36.5 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  34.77 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  36.93 
 
 
517 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  35.87 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  36.73 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  34.08 
 
 
296 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  35.42 
 
 
293 aa  168  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  33.8 
 
 
379 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  35.19 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  36.86 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  34.15 
 
 
305 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  33.84 
 
 
305 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  29.75 
 
 
322 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
313 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  31.73 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  33.12 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  33.12 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  31.43 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  29.06 
 
 
299 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  33.33 
 
 
295 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  33.45 
 
 
296 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.82 
 
 
289 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
304 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
300 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
304 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
306 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  29.1 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  31.99 
 
 
303 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  32.85 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  31.41 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  31.99 
 
 
308 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  31.78 
 
 
300 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  31.23 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
297 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  29.01 
 
 
333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.82 
 
 
483 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  30.11 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  30.43 
 
 
339 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  31.58 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  31.2 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.72 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.48 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  30.04 
 
 
332 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  29.96 
 
 
294 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  29.96 
 
 
274 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  31.08 
 
 
293 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  30.04 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.04 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.04 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.04 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.04 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  33.57 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  31.54 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.62 
 
 
478 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.04 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.07 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  30.89 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  29.96 
 
 
304 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  28.39 
 
 
303 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  30.31 
 
 
312 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  31.07 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  30.89 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.43 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.63 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  26.81 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  28.2 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  29.71 
 
 
303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  28.31 
 
 
317 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  28.97 
 
 
288 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  29.32 
 
 
284 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
377 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  31.33 
 
 
682 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  32.6 
 
 
299 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
404 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  30.34 
 
 
305 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  28.82 
 
 
333 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  30.34 
 
 
305 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>