More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3615 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  100 
 
 
304 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  97.87 
 
 
304 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  97.84 
 
 
304 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  74.73 
 
 
307 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
315 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  33.77 
 
 
309 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30.35 
 
 
315 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  35.69 
 
 
304 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  37.08 
 
 
307 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  32.32 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  33.46 
 
 
341 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  32.58 
 
 
328 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.99 
 
 
331 aa  125  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.41 
 
 
318 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  31.58 
 
 
318 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.27 
 
 
351 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  36.63 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  33.59 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  30.68 
 
 
321 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.82 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.57 
 
 
335 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  30.45 
 
 
337 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  30.45 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  30.08 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  30.08 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  40.48 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
339 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  35.61 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.72 
 
 
287 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
354 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.29 
 
 
363 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  34.72 
 
 
289 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.58 
 
 
356 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  36.54 
 
 
303 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  32.08 
 
 
291 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  38.26 
 
 
292 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  23.79 
 
 
274 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  32.95 
 
 
289 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  31.44 
 
 
517 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.19 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  31.13 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  27.45 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
379 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  35.2 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  32.73 
 
 
682 aa  95.5  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  29.5 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  29.92 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  23.72 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  35.48 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  33.09 
 
 
682 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  35.16 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  30.89 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  34.82 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  35.61 
 
 
299 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00921  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  22.98 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  26.82 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  32.55 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  36.98 
 
 
323 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  30.3 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1056  hypothetical protein  34.14 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.4 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  31.68 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  24.73 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  33.82 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11530  hypothetical protein  33.73 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  35.29 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  30.72 
 
 
406 aa  89.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  32.55 
 
 
284 aa  89.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  24.61 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  25.94 
 
 
293 aa  89.7  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
322 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.22 
 
 
288 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  22.53 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.72 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3099  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.17 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.36 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.1 
 
 
483 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  35.85 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.44 
 
 
313 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  29.5 
 
 
300 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  28.24 
 
 
700 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  25.1 
 
 
276 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  30 
 
 
300 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
294 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  22.67 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  25.38 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2808  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2752  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  29.39 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  24.11 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  23.9 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  24.11 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  24.11 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>