More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1374 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  100 
 
 
331 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  54.98 
 
 
335 aa  362  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  48.04 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  51.46 
 
 
351 aa  299  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  44.78 
 
 
321 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  41.64 
 
 
338 aa  232  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  41.64 
 
 
338 aa  232  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  40.36 
 
 
338 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  39.5 
 
 
337 aa  222  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  40.99 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  37.63 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  37.04 
 
 
315 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  36.09 
 
 
341 aa  195  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  37.81 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  36.75 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  34.42 
 
 
363 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  35.31 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  36.2 
 
 
318 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  33.81 
 
 
300 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  36.92 
 
 
517 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  36.24 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
309 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  36.33 
 
 
322 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  34.81 
 
 
379 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  35.97 
 
 
318 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  32.71 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  33.57 
 
 
328 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  35.16 
 
 
304 aa  155  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  29.78 
 
 
287 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  30.68 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  32.08 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  30.12 
 
 
274 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  30.12 
 
 
274 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  31.62 
 
 
288 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  30.35 
 
 
294 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  29.18 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  30.86 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
294 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.33 
 
 
254 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.08 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  29.64 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.55 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.25 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.04 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  30.16 
 
 
275 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
275 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.55 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  30.48 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  31.63 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
318 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  27.31 
 
 
300 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  27.99 
 
 
304 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  30.85 
 
 
289 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.81 
 
 
297 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
300 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  29.48 
 
 
276 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
284 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  28.87 
 
 
305 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
299 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
299 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
278 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  29.72 
 
 
305 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.73 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.73 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  28.73 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3326  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.73 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  28.3 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  26.77 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  28.17 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  30.21 
 
 
312 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.4 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  26.48 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
682 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  25.56 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.73 
 
 
682 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  28.3 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  27.94 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 
478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2323  periplasmic binding protein  31.6 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  29.01 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  27.48 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  29.33 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0786  vitamin B12-transporter protein BtuF  25.1 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  26.88 
 
 
295 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  25.72 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  27.41 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  26.46 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.41 
 
 
310 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.41 
 
 
310 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>