More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0632 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  100 
 
 
295 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  100 
 
 
295 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  70.85 
 
 
295 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  37.7 
 
 
318 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  36.66 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
322 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  36.29 
 
 
341 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  34.01 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  32.77 
 
 
305 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  37.2 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  37.2 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  35.91 
 
 
318 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  30.08 
 
 
322 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  31.48 
 
 
354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  30.35 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  30.29 
 
 
307 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.09 
 
 
335 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.28 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
293 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  28.46 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  25.68 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  29.64 
 
 
318 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
312 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  30.23 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2808  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  28.63 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  28.32 
 
 
276 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  26.46 
 
 
404 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.57 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  26.71 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  28.84 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
300 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.67 
 
 
331 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.36 
 
 
311 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  28.46 
 
 
261 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  29.25 
 
 
289 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
291 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  22.18 
 
 
316 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
309 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.94 
 
 
309 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  26.47 
 
 
314 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.22 
 
 
287 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3099  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.69 
 
 
276 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
296 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.01 
 
 
313 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.24 
 
 
275 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  27.57 
 
 
289 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  25.61 
 
 
299 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
317 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  29.13 
 
 
312 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0786  vitamin B12-transporter protein BtuF  26 
 
 
268 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
289 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
270 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
299 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  26.3 
 
 
304 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  25.25 
 
 
312 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  28.84 
 
 
296 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  25.7 
 
 
280 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3326  vitamin B12-transporter protein BtuF  25.7 
 
 
280 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  25.7 
 
 
280 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  25.44 
 
 
293 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  28.84 
 
 
296 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.34 
 
 
339 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0229  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.27 
 
 
262 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0243  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.27 
 
 
262 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0226  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.27 
 
 
262 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
300 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0227  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.27 
 
 
262 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  normal  0.717087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  25.28 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0245  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.27 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.168683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  27.39 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2366  periplasmic binding protein  25.53 
 
 
308 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.88 
 
 
310 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1039  periplasmic binding protein  25.2 
 
 
272 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
287 aa  99  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00157  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.06 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  28.15 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  26.88 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00156  hypothetical protein  27.06 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3444  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0162  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.06 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0170  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.06 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.88 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3501  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.06 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0163  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.06 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  25.19 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0657  periplasmic binding protein  25.48 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.713656  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  24.71 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  26.52 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.52 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.52 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2498  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.52 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.38 
 
 
338 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0168  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.67 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>