More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1296 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 
305 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  98.03 
 
 
305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  43.23 
 
 
311 aa  259  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  34.64 
 
 
314 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  36.42 
 
 
295 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  30.56 
 
 
318 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  30.82 
 
 
322 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  35.48 
 
 
318 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  37.41 
 
 
315 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  37.68 
 
 
315 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  32.77 
 
 
295 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  32.77 
 
 
295 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  34.86 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  34.42 
 
 
339 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  31.76 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.04 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  30.28 
 
 
354 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  32.83 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  35.94 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.87 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  30.31 
 
 
289 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  30.21 
 
 
379 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.9 
 
 
289 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.82 
 
 
331 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.13 
 
 
318 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  30.96 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  32.32 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  27.33 
 
 
312 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  26.28 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.36 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.1 
 
 
296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  29.66 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
299 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  29.82 
 
 
308 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  29.93 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.89 
 
 
311 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  29.88 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
303 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
311 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  25.18 
 
 
300 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.69 
 
 
333 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.42 
 
 
304 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  29.58 
 
 
333 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
316 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
406 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
312 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
305 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
305 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  24.39 
 
 
300 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
305 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
337 aa  99  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.35 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  28.3 
 
 
312 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  25.82 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  26.53 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  24.74 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  30.31 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.27 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.27 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  26.69 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
318 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  24.66 
 
 
339 aa  96.3  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  28.32 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.05 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.72 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.8 
 
 
682 aa  94.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2366  periplasmic binding protein  26.99 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2734  ABC transporter substrate binding protein (hemin)  27.72 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  23.3 
 
 
391 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  29.05 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  24.32 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  24.09 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  26.54 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3569  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
269 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135513  hitchhiker  0.00885259 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.48 
 
 
682 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  23.68 
 
 
377 aa  92.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  26.2 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  26.01 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  28.36 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
292 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.2 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2498  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
310 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.2 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  25.83 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  28.28 
 
 
333 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.2 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  30.23 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  25.48 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  26.98 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.29 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3326  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.29 
 
 
280 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.29 
 
 
280 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>