More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1896 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  100 
 
 		 316 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  37.24 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  32.86 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  31.82 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  31.47 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  34.13 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  28.92 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  27.9 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  30 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0464  ABC-type transport system, periplasmic component  27.09 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  27.87 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.59 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.82 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  23.6 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 351 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 354 aa  99.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  26.77 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  25 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  21.95 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.53 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  22.31 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 406 aa  89.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  27 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  24.63 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  28.4 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  23.26 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  29.95 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  30.13 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  22.92 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  22.92 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.67 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  22.98 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  20.07 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.37 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.42 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  26.79 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  22.61 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0880  corrinoid ABC transporter substrate-binding protein  26.09 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.65 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  25 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  26.65 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  20.94 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  25.21 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  25 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  23.15 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  23.97 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  21.82 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  21.46 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  27.83 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 361 aa  72.4  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  22.06 
 
 		 682 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  22.42 
 
 		 682 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  25.9 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>