More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1421 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  100 
 
 		 379 aa  758    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  36.45 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  35.92 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  36.42 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  35.22 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  35.37 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  37.15 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  33.97 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  34.02 
 
 		 315 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  33.8 
 
 		 315 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  35.31 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  35.33 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  31.85 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  31.85 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  32.99 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  33.8 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  32.58 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  35.64 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  34.38 
 
 		 291 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  32.88 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  31.95 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  33.93 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  32.76 
 
 		 322 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  30.52 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  31.83 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.02 
 
 		 287 aa  136  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  30.85 
 
 		 363 aa  136  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  34.59 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  32.99 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  33.69 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  30.07 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  31.67 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  30.31 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.46 
 
 		 275 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.29 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  33.82 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  30 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2808  periplasmic binding protein  30.92 
 
 		 265 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  30.21 
 
 		 305 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  29.73 
 
 		 278 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  31.94 
 
 		 517 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 321 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 312 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  32.77 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.5 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  30.03 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  30.94 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  31.43 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  29.81 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  29.37 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  29.37 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 284 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.09 
 
 		 304 aa  120  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  28.27 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.36 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1039  periplasmic binding protein  32.05 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3326  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.36 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.36 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00157  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.62 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3444  periplasmic binding protein  30.62 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.15 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00156  hypothetical protein  30.62 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0163  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.62 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0170  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.62 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0162  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.62 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3501  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.62 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0168  vitamin B12-transporter protein BtuF  30.62 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  30.07 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  29.47 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  30.61 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 		 304 aa  117  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 299 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3099  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.41 
 
 		 276 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  30.69 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 274 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.92 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  27.85 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  30.72 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  31.32 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  32.08 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>