More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0428 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  100 
 
 
375 aa  770    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  47.52 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  27.4 
 
 
378 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  30.08 
 
 
358 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  27.84 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  27.84 
 
 
403 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
362 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  30.27 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
374 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  26.59 
 
 
401 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.39 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  30.29 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  28.49 
 
 
386 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
374 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  29.15 
 
 
375 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  26.42 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  28.19 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  27.2 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  30.72 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  29.38 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  28.14 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  29.31 
 
 
689 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.11 
 
 
376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
381 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
373 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
350 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  30.6 
 
 
372 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  29.04 
 
 
688 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.97 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.47 
 
 
338 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.47 
 
 
338 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
390 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  27.6 
 
 
373 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  28.16 
 
 
396 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
350 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
350 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
350 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.13 
 
 
354 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
350 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.47 
 
 
337 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  27.63 
 
 
393 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  24.86 
 
 
384 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  25.3 
 
 
372 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.25 
 
 
315 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
361 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.74 
 
 
373 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  26.33 
 
 
367 aa  103  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.84 
 
 
338 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
333 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  27.27 
 
 
381 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
315 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  24.93 
 
 
370 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
389 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.44 
 
 
389 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.18 
 
 
381 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  26.24 
 
 
387 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
366 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
374 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
384 aa  99.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.14 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  26.46 
 
 
370 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
351 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  23.32 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.18 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  24.4 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
366 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  22.35 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  27.08 
 
 
337 aa  97.1  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
354 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 
351 aa  96.7  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  25.44 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  27.98 
 
 
335 aa  96.3  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  25.99 
 
 
349 aa  96.3  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  27.51 
 
 
362 aa  95.9  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  30.57 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  26.72 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.47 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  22.58 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  27.49 
 
 
397 aa  94  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.84 
 
 
307 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  27.44 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.17 
 
 
369 aa  93.2  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.61 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  25.13 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.04 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.54 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  25.71 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  27.25 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  24.27 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>