More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0229 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  100 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  68.49 
 
 		 291 aa  414  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  54.41 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  45.92 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  43.23 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  40.42 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  40.37 
 
 		 291 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  41.44 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  40.08 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  38.81 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  39.62 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  38.93 
 
 		 323 aa  201  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  38.85 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  40.98 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  38.4 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  42.42 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  38.37 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  36.04 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  35.84 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  34.69 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 315 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  32.97 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  34.98 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  34.31 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  33.8 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  34.75 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  34.75 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  34.75 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  36.9 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  34.4 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  36.73 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  31.88 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  31.88 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  27.97 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.09 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  32.06 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  33.7 
 
 		 406 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  31.05 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  29.33 
 
 		 363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  33.6 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.93 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.86 
 
 		 356 aa  125  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  32.97 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  34.74 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  32.95 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  33.84 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  32.86 
 
 		 517 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  31.7 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.44 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  28.04 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 		 483 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  31.58 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  30.96 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.2 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  31.53 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  31.58 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  29.18 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.57 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  30.57 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  32.09 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.57 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  33.58 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.57 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  30.57 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.57 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  31.75 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  32.34 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  30.57 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  28.05 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  30.45 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  31.37 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  27.06 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  30.32 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.37 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  32.34 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.22 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 478 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>