More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1148 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
304 aa  626  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  63.09 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  63.14 
 
 
304 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  60.9 
 
 
288 aa  363  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  57.84 
 
 
293 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  58.97 
 
 
293 aa  341  9e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  54.98 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  35.38 
 
 
307 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  33.85 
 
 
341 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  27.36 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  32.2 
 
 
363 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.02 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  30 
 
 
300 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  34.46 
 
 
296 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30 
 
 
275 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  30.03 
 
 
274 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  33.2 
 
 
293 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  27.95 
 
 
309 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  33.46 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  31.32 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  32.43 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  30.11 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  29.01 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.66 
 
 
356 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  31.66 
 
 
517 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  30 
 
 
379 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  31.93 
 
 
276 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.48 
 
 
338 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  30.61 
 
 
300 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  29.86 
 
 
275 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.96 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  31.66 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  31.89 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  26.83 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  26.83 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.23 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.6 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.6 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  31.6 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  27.95 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.6 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.6 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.78 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.6 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.34 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  30.31 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  30.71 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
351 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  30.31 
 
 
275 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  29.85 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  30.31 
 
 
275 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.23 
 
 
310 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  27.8 
 
 
289 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  33.59 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
276 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.48 
 
 
287 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.06 
 
 
309 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  30.11 
 
 
322 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  30.19 
 
 
321 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29 
 
 
483 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  30.27 
 
 
382 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  30.08 
 
 
311 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  25.25 
 
 
295 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  28.52 
 
 
312 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
300 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
303 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
318 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.82 
 
 
318 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.3 
 
 
313 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  30.55 
 
 
284 aa  102  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.5 
 
 
478 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  28.63 
 
 
305 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25.36 
 
 
331 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  29.73 
 
 
287 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  30.12 
 
 
317 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  30.82 
 
 
333 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  30.08 
 
 
306 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  29.01 
 
 
305 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  29.01 
 
 
305 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  29.01 
 
 
305 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  27.86 
 
 
304 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  31.8 
 
 
321 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2161  periplasmic binding protein  26.17 
 
 
299 aa  99  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  29.48 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  26.41 
 
 
300 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
257 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>