More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1099 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  98.65 
 
 		 296 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  77.44 
 
 		 323 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  70.08 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  65.14 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  68.91 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  62.8 
 
 		 289 aa  352  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  62.22 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  60.23 
 
 		 292 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  57.2 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  52.61 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  55.91 
 
 		 300 aa  271  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  48.34 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  40.08 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  37.4 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  38.13 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  38.16 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  31.5 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  33.45 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  31.91 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  31.39 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  32.25 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.73 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  37.08 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  33.66 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  29.83 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  31.64 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.04 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.97 
 
 		 379 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.12 
 
 		 483 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1713  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.917384  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  28.42 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  28.42 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  30.15 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  31.16 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  31.17 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  28.84 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  28.84 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  28.01 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 404 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 339 aa  96.3  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 478 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  35.04 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  31.14 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  32.25 
 
 		 382 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  31.09 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27.34 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  26.12 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.1 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  36.22 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  34.77 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 682 aa  90.5  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8855  periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.461733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.56 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  23.53 
 
 		 363 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  29 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.7 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  29.62 
 
 		 682 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  35.47 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.04 
 
 		 356 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.24 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  28.32 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>