More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1372 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  54.98 
 
 
331 aa  363  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  43.63 
 
 
354 aa  275  9e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  44.16 
 
 
351 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  42.18 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  42.96 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  42.96 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  41.7 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  40.07 
 
 
315 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  38.99 
 
 
315 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  41.43 
 
 
337 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  38.43 
 
 
307 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  37.01 
 
 
341 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  34.63 
 
 
318 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  34.98 
 
 
318 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  36.27 
 
 
318 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  35.53 
 
 
517 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  34.8 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  33.69 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.61 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  35.97 
 
 
318 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  35.33 
 
 
379 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  34.38 
 
 
322 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
309 aa  159  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  34.52 
 
 
304 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  32.37 
 
 
300 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  31.48 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  29.3 
 
 
287 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  31.61 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  31.76 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  30.34 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  30.36 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  30.63 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  29.3 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  28.25 
 
 
315 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  28.09 
 
 
295 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
300 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  28.09 
 
 
295 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  28.76 
 
 
299 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.43 
 
 
297 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  26.8 
 
 
294 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  27.72 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.53 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  30.88 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  30.46 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.75 
 
 
289 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  26.89 
 
 
299 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  32.48 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
296 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
250 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  29.97 
 
 
303 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
304 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  28 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  29.19 
 
 
300 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.46 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3326  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.46 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.46 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.59 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
274 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  28.16 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  28.14 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.77 
 
 
287 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
274 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  25.58 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  27.91 
 
 
274 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
300 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.78 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  30.35 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.46 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.54 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  28.18 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  27.86 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  25.84 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  28.87 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  25.73 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
294 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
278 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
303 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.88 
 
 
254 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  26.16 
 
 
293 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
257 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  28.39 
 
 
344 aa  109  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  26.42 
 
 
275 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
275 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  27.91 
 
 
275 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
304 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
312 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
275 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  26.25 
 
 
288 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  27.67 
 
 
359 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1039  periplasmic binding protein  29.84 
 
 
272 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  28.37 
 
 
308 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>