More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1115 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  98.03 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  43.23 
 
 		 311 aa  261  8e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  35 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  37.29 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  30.86 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  35.84 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  36.04 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  37.77 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  34.01 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  34.01 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  38.04 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  34.06 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  31.61 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.04 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  33.21 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  31.36 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  34.88 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  31.08 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  28.98 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  33.08 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.38 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  30.04 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  30.58 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  31.16 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  29.12 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.91 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  28.8 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 406 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.72 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.72 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 333 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.12 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  25.45 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  24.04 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.36 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  30.71 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  25 
 
 		 339 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.5 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2366  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.01 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.01 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  26.84 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.01 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.01 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.64 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2498  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.26 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  24.01 
 
 		 391 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  30.58 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  28.97 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2734  ABC transporter substrate binding protein (hemin)  28.46 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3569  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135513  hitchhiker  0.00885259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.28 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 352 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  23.72 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2937  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000364974  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 682 aa  92.8  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.66 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 375 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.4 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.4 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>