More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0555 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  100 
 
 
317 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0053  periplasmic binding protein  33.94 
 
 
298 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  34.03 
 
 
318 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  32.48 
 
 
299 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
307 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  29.85 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  32.04 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.95 
 
 
322 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.79 
 
 
483 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.68 
 
 
318 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
315 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.75 
 
 
315 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  31.47 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.45 
 
 
478 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  30 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  29.74 
 
 
295 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  28.76 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
309 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1713  periplasmic binding protein  32.17 
 
 
289 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.917384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
354 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
295 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
295 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  30.58 
 
 
300 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  26.35 
 
 
341 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
296 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
289 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  28.12 
 
 
348 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.8 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
379 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  26.62 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  27.56 
 
 
517 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.27 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  28.31 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25.17 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.23 
 
 
309 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  26.69 
 
 
321 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  25.54 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.78 
 
 
339 aa  92.8  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.44 
 
 
682 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  26.54 
 
 
305 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.15 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.34 
 
 
380 aa  92.4  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  22.03 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  25.99 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  27.57 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  25.68 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  26.49 
 
 
284 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.67 
 
 
682 aa  89.4  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
426 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  22.03 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  22.03 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  29.55 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.95 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  24.16 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  26.3 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.23 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  25.22 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  28.72 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.17 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  21.8 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.31 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.22 
 
 
375 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  26.72 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  25.48 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
723 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  23.85 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  25.93 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
723 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  24.22 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  27.44 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  24.64 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.67 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.64 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.64 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  24.3 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  27.2 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.9 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  24.64 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.64 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.64 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.64 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  23.91 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  28.23 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.84 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  23.19 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  25.97 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  28.9 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  24.71 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  25.72 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  22.82 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.33 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>