211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3569 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3569  periplasmic binding protein  100 
 
 		 269 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135513  hitchhiker  0.00885259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  39.26 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  37.27 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2093  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.74 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.839257  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1104  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  27.43 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.43 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  35.2 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  28.64 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  34.3 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.96 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.96 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.96 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  24.59 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  32.58 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0880  corrinoid ABC transporter substrate-binding protein  31.16 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  28.44 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  34.3 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  28.7 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  22.37 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.13 
 
 		 356 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  29.49 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  32.39 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  32.35 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.33 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  32.26 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  34.13 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.41 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  35.93 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  28.31 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.31 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  27.98 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  34.58 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  24.64 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.72 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2011  periplasmic binding protein  36.59 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0162028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  33.74 
 
 		 682 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3080  periplasmic binding protein  38.76 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.11 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0112  periplasmic binding protein  31.42 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.195536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  33.74 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  33.8 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  32.37 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.63 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2790  periplasmic binding protein  35.63 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.578873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.51 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  29.95 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.64 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.87 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.8 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  37.23 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  30.88 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  45.35 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2937  periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000364974  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  22.73 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  31.4 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.59 
 
 		 478 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  34.68 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  31.86 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0904  putative substrate-binding protein  33.99 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.79 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  20.93 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.04 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  22.8 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1931  periplasmic binding protein  31.63 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>