More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0227 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  100 
 
 
682 aa  1352    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  97.65 
 
 
682 aa  1324    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
723 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  27.73 
 
 
723 aa  178  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  30.48 
 
 
323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  28.38 
 
 
327 aa  134  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  29.13 
 
 
334 aa  126  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  31.33 
 
 
315 aa  124  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  31.14 
 
 
349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  30.4 
 
 
354 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  31.64 
 
 
345 aa  117  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
354 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  31.97 
 
 
315 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  27.94 
 
 
337 aa  110  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  29.61 
 
 
349 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.35 
 
 
353 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.6 
 
 
331 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.62 
 
 
338 aa  108  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.62 
 
 
338 aa  108  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.69 
 
 
478 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
341 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 
351 aa  105  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  28.06 
 
 
368 aa  104  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  32.99 
 
 
297 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
379 aa  104  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.99 
 
 
393 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.09 
 
 
338 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
344 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.9 
 
 
309 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.75 
 
 
354 aa  102  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
350 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
350 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
350 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  28.8 
 
 
318 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  32.17 
 
 
345 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
350 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.52 
 
 
351 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  30.56 
 
 
483 aa  101  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
358 aa  101  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  29.54 
 
 
353 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  27.52 
 
 
350 aa  100  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
351 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  27.84 
 
 
351 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  29.62 
 
 
328 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.49 
 
 
363 aa  97.8  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
361 aa  97.8  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.92 
 
 
337 aa  96.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
354 aa  96.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.78 
 
 
370 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  30.57 
 
 
354 aa  95.5  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.92 
 
 
344 aa  95.5  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
333 aa  94.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.61 
 
 
362 aa  95.1  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
313 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  33.09 
 
 
304 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.95 
 
 
386 aa  94.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  29.2 
 
 
382 aa  94.4  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.3 
 
 
344 aa  94.4  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.41 
 
 
337 aa  94  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  28.93 
 
 
375 aa  94.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.39 
 
 
362 aa  94  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  23.96 
 
 
353 aa  94  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
337 aa  93.6  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  26.59 
 
 
393 aa  93.2  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  26.03 
 
 
360 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  28.44 
 
 
317 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.08 
 
 
365 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.97 
 
 
318 aa  92.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  28.48 
 
 
305 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.47 
 
 
377 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  27.11 
 
 
296 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  27.61 
 
 
338 aa  91.3  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  29.55 
 
 
305 aa  91.3  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
287 aa  90.9  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  32.37 
 
 
304 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
354 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  29.69 
 
 
296 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  26.1 
 
 
341 aa  89.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.01 
 
 
289 aa  89.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
300 aa  89  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
307 aa  89  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_27  iron ion ABC transporter, periplasmic component  25.17 
 
 
354 aa  88.6  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0380632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  25.73 
 
 
345 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.21 
 
 
370 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.33 
 
 
369 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
318 aa  87.8  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
296 aa  87.4  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  24.5 
 
 
335 aa  87.4  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
303 aa  87.4  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
380 aa  87.4  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  24.76 
 
 
377 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  30.67 
 
 
323 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  23.45 
 
 
366 aa  87  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  29.97 
 
 
312 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  29.73 
 
 
299 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.35 
 
 
313 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  26.98 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.85 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  24.65 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>