More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2743 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1433    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  40.61 
 
 		 255 aa  169  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  39.11 
 
 		 282 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  34.38 
 
 		 254 aa  138  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  36.05 
 
 		 256 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  36.32 
 
 		 254 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  36 
 
 		 254 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  33.97 
 
 		 260 aa  134  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  35.62 
 
 		 256 aa  134  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  35.62 
 
 		 256 aa  134  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  33.59 
 
 		 260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  35.19 
 
 		 256 aa  130  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  32.03 
 
 		 255 aa  127  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 307 aa  124  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  31.95 
 
 		 386 aa  114  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  31.91 
 
 		 268 aa  110  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  31.91 
 
 		 268 aa  110  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  30.86 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  32.49 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 315 aa  104  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  33.19 
 
 		 259 aa  103  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  33.19 
 
 		 259 aa  103  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 341 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 322 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 291 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 318 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  33.66 
 
 		 372 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25 
 
 		 331 aa  95.9  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 339 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 318 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.16 
 
 		 356 aa  91.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  27.8 
 
 		 517 aa  91.3  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  30.26 
 
 		 361 aa  90.9  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 328 aa  90.5  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.46 
 
 		 338 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28 
 
 		 297 aa  89  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 321 aa  89  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 304 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  29.04 
 
 		 292 aa  87.8  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 299 aa  87  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.92 
 
 		 335 aa  87  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 304 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  31.22 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  22.19 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  22.78 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  23.74 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  23.74 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.65 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.55 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 289 aa  80.5  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 346 aa  79.7  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 289 aa  79.7  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.17 
 
 		 483 aa  77  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  22.89 
 
 		 359 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 296 aa  77  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 318 aa  77  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  26.7 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  23.3 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 379 aa  73.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 297 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 257 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 312 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 323 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  26.38 
 
 		 307 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  24.04 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  25 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  26.77 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  25 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 312 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  22.52 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  21.94 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.81 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  24.34 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>