253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1007 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  100 
 
 
342 aa  693    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  35.63 
 
 
342 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  35.63 
 
 
342 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  36.74 
 
 
347 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  40.28 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  35.87 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  36.97 
 
 
316 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  36.62 
 
 
316 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  28.99 
 
 
336 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  33.1 
 
 
309 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  33.1 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  32.83 
 
 
341 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  31.9 
 
 
318 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  31.25 
 
 
317 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  31.25 
 
 
317 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
317 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  33.1 
 
 
330 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  31.52 
 
 
315 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  33.09 
 
 
321 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  32.32 
 
 
314 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.01 
 
 
307 aa  138  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  31.67 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  29.75 
 
 
340 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  32.45 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  32.06 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  33.21 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.97 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  32.62 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  30.47 
 
 
293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.56 
 
 
312 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  29.5 
 
 
302 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  31.94 
 
 
297 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  30.18 
 
 
302 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  29.89 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  29.96 
 
 
302 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  28.88 
 
 
339 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  27.64 
 
 
340 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.99 
 
 
338 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
322 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  27.47 
 
 
327 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.99 
 
 
337 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.99 
 
 
333 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.23 
 
 
337 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.37 
 
 
337 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.37 
 
 
337 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  30.91 
 
 
301 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.23 
 
 
337 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
340 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.06 
 
 
337 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
337 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  31.08 
 
 
337 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.86 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04580  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
334 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.398248  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
288 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  28.02 
 
 
353 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  30.61 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.41 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.41 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  28.78 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  26.07 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.41 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  29.35 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.68 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.68 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.68 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.68 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.64 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  27.14 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  24.24 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.57 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.99 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  22.73 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  24.73 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  25.19 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.62 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  22.76 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  24.15 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  24.54 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.73 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3293  periplasmic binding protein  24.21 
 
 
288 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  24.32 
 
 
362 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  24.21 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.68 
 
 
375 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  23.53 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  23.05 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  25.1 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  23.39 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  23.08 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  23.97 
 
 
662 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.27 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  25.3 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>