More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1042 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  100 
 
 
354 aa  721    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  88.7 
 
 
354 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  34.86 
 
 
354 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  34.6 
 
 
361 aa  182  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  34.44 
 
 
356 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  32.63 
 
 
409 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  33.7 
 
 
372 aa  169  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  30.48 
 
 
338 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  35.49 
 
 
483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  34.56 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  31.31 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  33.84 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  35.53 
 
 
358 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 
478 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.75 
 
 
375 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  30.32 
 
 
380 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  28.45 
 
 
359 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  32.64 
 
 
339 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  28.69 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  30.75 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  28.95 
 
 
429 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.03 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.8 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  29.56 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  25.67 
 
 
426 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  26.52 
 
 
333 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.58 
 
 
406 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
390 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  27.72 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.13 
 
 
427 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  30.33 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  28.61 
 
 
383 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
375 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  28.73 
 
 
377 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.55 
 
 
344 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  29.31 
 
 
375 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.01 
 
 
389 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.01 
 
 
381 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
389 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
362 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
333 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  26.58 
 
 
377 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
334 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.84 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.41 
 
 
362 aa  99.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.9 
 
 
350 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.76 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
351 aa  97.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.87 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.87 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.53 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.53 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
377 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  27.7 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  31.02 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.53 
 
 
426 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  26.46 
 
 
406 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  23.78 
 
 
370 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  25.87 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  28.03 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  29.72 
 
 
682 aa  90.5  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  30.8 
 
 
267 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  29.2 
 
 
409 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
682 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.03 
 
 
429 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.4 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
372 aa  89.7  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  23.87 
 
 
371 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.54 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.84 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
689 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.79 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  24.66 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.99 
 
 
365 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  27.89 
 
 
688 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.18 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  25.13 
 
 
375 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  25.13 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
373 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  24.5 
 
 
364 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.6 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.4 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.46 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>