More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0972 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  100 
 
 		 429 aa  888    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  35.9 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  34.19 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.59 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  30.75 
 
 		 483 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 380 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  30.45 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.83 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 358 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.37 
 
 		 384 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 350 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 350 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.95 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 350 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.71 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.71 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 315 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 297 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.14 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 333 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.8 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.94 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 723 aa  87  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 723 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  26.13 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.44 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.28 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.57 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  24.71 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.67 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  23.93 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  23.63 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  23.63 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.63 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  22.32 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  26.74 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  23.88 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>