More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1593 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  100 
 
 		 372 aa  753    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  76.49 
 
 		 356 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  62.76 
 
 		 361 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  49.3 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  38.01 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  34.72 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 354 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  33.7 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  32.45 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 354 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.59 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  33.04 
 
 		 483 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  32.29 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 380 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  33.2 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 366 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 375 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.82 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.01 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 315 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.3 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.38 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.65 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.65 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.33 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 682 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 682 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.67 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.54 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.07 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  26.69 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.79 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.79 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.64 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  27.59 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 723 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  26.3 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  27.02 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  26.23 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.93 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.61 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.09 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.74 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.53 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  22.25 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  26.15 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  23.88 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  25.85 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  23.84 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  21.57 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  21.98 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>