More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0435 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  100 
 
 		 362 aa  737    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  49.3 
 
 		 372 aa  335  5e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  47.18 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  45.38 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  31.98 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  30.59 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  31.46 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  30.75 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  30 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  31.18 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.15 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  28.87 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.77 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 402 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  29.83 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.32 
 
 		 478 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  27.82 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  28.83 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.78 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  27 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 375 aa  89.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  25.46 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 394 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.54 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.88 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  26.84 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.63 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  23.37 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  26.75 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  26.14 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.89 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 682 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  24.63 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.11 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  28.38 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.18 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  24.92 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  25 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  27.4 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.18 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 689 aa  70.5  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  27.33 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  25.27 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.33 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.06 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  26.69 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  26.69 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.91 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>