More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0547 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  100 
 
 		 359 aa  733    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  36.13 
 
 		 478 aa  225  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  36.34 
 
 		 483 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  33.65 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  32.89 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.41 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.97 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  31.1 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30.42 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 429 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  28.82 
 
 		 517 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  27.67 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.08 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.02 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  26.76 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  26.76 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.75 
 
 		 406 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  26.38 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.92 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 322 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 296 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  30.66 
 
 		 318 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.94 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  24.04 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  25 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.41 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  27.97 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 375 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  25.22 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.25 
 
 		 304 aa  89.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.9 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 269 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  25 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  23.51 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  22.75 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.39 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  26.75 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.61 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.56 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  22.28 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  23.91 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  23.01 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>