More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1481 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  100 
 
 		 354 aa  722    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  80.12 
 
 		 354 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  79.25 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  69.19 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  65.98 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  65.47 
 
 		 350 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  65.17 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  65.17 
 
 		 350 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  64.56 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  60.24 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  62.08 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  48.36 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  29.68 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.61 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  29.2 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  31.49 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  32.24 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.88 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.3 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.79 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.81 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.51 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.31 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  29.38 
 
 		 403 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  29.27 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  28.32 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  31.17 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  28.99 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  29.04 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  29.26 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  29.62 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  29.26 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  25.68 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  31.18 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 682 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 360 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  30.91 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.75 
 
 		 682 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.61 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.92 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  26.98 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  30.61 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  31.06 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 375 aa  95.9  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.91 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  22.58 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.76 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  26.82 
 
 		 381 aa  93.6  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.92 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  31.92 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  27.53 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>