More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1185 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  88.7 
 
 		 354 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  100 
 
 		 354 aa  714    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  34.76 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  34.44 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  32.74 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  35.29 
 
 		 483 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  33.84 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  32.22 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  34.66 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 478 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  34.59 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.65 
 
 		 375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  29.91 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  33.19 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  29 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  30 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  27.15 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.31 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  30.4 
 
 		 427 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  26.13 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.94 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.88 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  29.49 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.89 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.15 
 
 		 381 aa  99.4  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.15 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.58 
 
 		 362 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.15 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 682 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 682 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.76 
 
 		 426 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 267 aa  94  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.26 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 409 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 350 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.91 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  30.72 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  26.07 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  30 
 
 		 688 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 372 aa  89.7  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 689 aa  89.4  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 289 aa  85.9  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.66 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.45 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.75 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.61 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>