More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0779 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 450 aa  922    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  41.45 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  40.07 
 
 		 287 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  40.07 
 
 		 287 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  37.97 
 
 		 341 aa  194  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  37.36 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  33.55 
 
 		 344 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  31.89 
 
 		 353 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  33.22 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  32.21 
 
 		 344 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  32.21 
 
 		 344 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  32.21 
 
 		 344 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  32.21 
 
 		 344 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  32.21 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  32.19 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  34.06 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  32.45 
 
 		 373 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  34.38 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  39.72 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  50.74 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  51.47 
 
 		 270 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  51.47 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  51.47 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  51.47 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  51.47 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  51.47 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  51.47 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  44.35 
 
 		 495 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  51.47 
 
 		 263 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.29 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 		 298 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  50.74 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  47.15 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  49.59 
 
 		 244 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  50 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  46.73 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2745  allergen V5/TPX-1 family protein  30.8 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  52.29 
 
 		 113 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  39.62 
 
 		 259 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.44 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  45.63 
 
 		 480 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.96 
 
 		 907 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  42.61 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  38.03 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  40.15 
 
 		 216 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  43.55 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  49.15 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  46.28 
 
 		 535 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  45.45 
 
 		 205 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  42.28 
 
 		 209 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  45.45 
 
 		 948 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  46.34 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  35.34 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  44.63 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  42.86 
 
 		 203 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  43.8 
 
 		 338 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40 
 
 		 213 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  34.48 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  38.36 
 
 		 282 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.27 
 
 		 129 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  45.53 
 
 		 287 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  45.45 
 
 		 214 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  38.93 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  42.52 
 
 		 264 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  47.66 
 
 		 280 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  45.37 
 
 		 249 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  41.98 
 
 		 312 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  40.19 
 
 		 292 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  45.6 
 
 		 245 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  41.18 
 
 		 212 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  42.42 
 
 		 258 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  35.66 
 
 		 591 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  41.67 
 
 		 211 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  32.86 
 
 		 502 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 		 650 aa  90.5  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  36.97 
 
 		 180 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  41.51 
 
 		 541 aa  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  35.29 
 
 		 331 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  27.56 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  39.34 
 
 		 495 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  41.8 
 
 		 317 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  35.48 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  37.72 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  41.35 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  31.32 
 
 		 269 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  38 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  38.26 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  38.05 
 
 		 263 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  40.95 
 
 		 298 aa  87  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  42.98 
 
 		 254 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  30.77 
 
 		 269 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  36.94 
 
 		 143 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  38.02 
 
 		 758 aa  86.7  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  36.97 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  33.99 
 
 		 323 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  41.44 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  42.15 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  36.77 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>