More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0528 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  100 
 
 
361 aa  724    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  63.2 
 
 
356 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  61.45 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  44.17 
 
 
362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  39.94 
 
 
377 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  37.5 
 
 
409 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  34.34 
 
 
354 aa  186  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  33.15 
 
 
354 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  33.62 
 
 
338 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  34.78 
 
 
483 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  31.97 
 
 
354 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  34.26 
 
 
333 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.29 
 
 
478 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
429 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  33.02 
 
 
358 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  29.19 
 
 
402 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  30.16 
 
 
366 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
380 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  30.59 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  33.2 
 
 
339 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.65 
 
 
375 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  28.49 
 
 
380 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  29.63 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  30.73 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  27.15 
 
 
377 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.03 
 
 
383 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
307 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
426 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.02 
 
 
315 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.73 
 
 
315 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
375 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  28.5 
 
 
364 aa  99.8  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
379 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.43 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
723 aa  89.7  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  27.2 
 
 
394 aa  89.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  25.28 
 
 
723 aa  88.6  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.37 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.17 
 
 
427 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  28 
 
 
363 aa  87  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  34.25 
 
 
267 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.36 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.36 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.48 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  23.75 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.97 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  24.37 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  25.44 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  25.59 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  26.58 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  26.58 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  25.97 
 
 
517 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.07 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.21 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  25.61 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  25.72 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.61 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  23.45 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  22.76 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25.79 
 
 
682 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.85 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.06 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.68 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  24.17 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
682 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.51 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.83 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  25 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  22.95 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.19 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1604  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  26.42 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  25 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  22.75 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.65 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  26.1 
 
 
358 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.39 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  22.5 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  25.96 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.09 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>