More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3389 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  99.14 
 
 
350 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  100 
 
 
350 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  98.86 
 
 
350 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  98.86 
 
 
350 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  80.8 
 
 
350 aa  591  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  64.08 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  67.18 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  64.41 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  60.29 
 
 
349 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  58.9 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  55.3 
 
 
351 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  45.24 
 
 
344 aa  335  5e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.2 
 
 
334 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
348 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  29.71 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.36 
 
 
374 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  30.97 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.58 
 
 
360 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
361 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  26.61 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.37 
 
 
357 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.75 
 
 
370 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  29.91 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.51 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  28.05 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  29.75 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.92 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  27.73 
 
 
397 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  27.94 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.68 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  27.79 
 
 
365 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.48 
 
 
375 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  27.65 
 
 
401 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  28.9 
 
 
387 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  29.76 
 
 
374 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.5 
 
 
362 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
375 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.86 
 
 
349 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
409 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
381 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  29.93 
 
 
322 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  29.14 
 
 
353 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
358 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
345 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
375 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
348 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  29.76 
 
 
358 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
386 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  26.71 
 
 
345 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.93 
 
 
393 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.72 
 
 
337 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
682 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.97 
 
 
682 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.53 
 
 
349 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
346 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  28.69 
 
 
349 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  25.99 
 
 
381 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
429 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.83 
 
 
353 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
378 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.46 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  26.46 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
358 aa  99.4  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 
478 aa  99.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  26.16 
 
 
346 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  25.53 
 
 
372 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  29.11 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  27.87 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
390 aa  96.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  27.86 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.6 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.87 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
341 aa  96.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.5 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.75 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.61 
 
 
354 aa  95.9  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  25.74 
 
 
403 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  28.23 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  23.62 
 
 
380 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  27.79 
 
 
384 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  28.44 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  24.12 
 
 
373 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  23.79 
 
 
314 aa  93.2  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
361 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.42 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  28.73 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.23 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  23.34 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.89 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.07 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
386 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.44 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  22.73 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.96 
 
 
359 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.27 
 
 
366 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>