More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3395 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  98.86 
 
 		 350 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  98.57 
 
 		 350 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  98.29 
 
 		 350 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  100 
 
 		 350 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  80.23 
 
 		 350 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  66.56 
 
 		 354 aa  464  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  63.51 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  63.82 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  60.58 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  58.28 
 
 		 353 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  55.01 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  45.24 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  28.83 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.06 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  29.14 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.28 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.94 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  30.21 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.38 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.44 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.22 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  27.73 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  27.49 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.33 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  27.94 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  29.29 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  27.22 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.19 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 375 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 387 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  29.93 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  27.11 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.61 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  29.14 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.87 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.63 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.58 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.88 
 
 		 682 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 682 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.55 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  25.73 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 378 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  28.23 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  27.58 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.5 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  28.7 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  24.63 
 
 		 390 aa  95.9  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.3 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.3 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  25.74 
 
 		 403 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.48 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.21 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  28.44 
 
 		 368 aa  89.4  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  24.76 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  24.92 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>