More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0185 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  100 
 
 		 426 aa  873    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  32.21 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  29.68 
 
 		 377 aa  154  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  28.35 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 356 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.23 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 354 aa  118  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 366 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.72 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 372 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 380 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 390 aa  93.2  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  23.09 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 338 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 359 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.45 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  24.4 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.91 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  28.15 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  24.45 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.71 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 682 aa  77  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  23.16 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  25 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  24.28 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  22.71 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  22.29 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  24.15 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  25.09 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  26.42 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.85 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.02 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  23.63 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  23.34 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  21.21 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  22.19 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  21.21 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  23.49 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  25 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.7 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.26 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  24.63 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.15 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  21.74 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  20.82 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  20.91 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.59 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  20.94 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  20.94 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  20.99 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0344  periplasmic binding protein  38.64 
 
 		 84 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.560526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  21.68 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  22.06 
 
 		 723 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  22 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  23.05 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  21.53 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>