More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1538 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  99.74 
 
 
389 aa  781    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  100 
 
 
381 aa  783    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  99.74 
 
 
389 aa  781    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  56.23 
 
 
383 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  52.15 
 
 
401 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  43.2 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  42.18 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.31 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  41.31 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  41.31 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  45.85 
 
 
367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  41.58 
 
 
370 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  44.66 
 
 
370 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  39.78 
 
 
377 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  40.37 
 
 
377 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  39.71 
 
 
375 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  40.62 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  42.28 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  41.19 
 
 
368 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  34.79 
 
 
375 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  38.15 
 
 
406 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  34.52 
 
 
375 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  38.84 
 
 
380 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  34.93 
 
 
373 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  34.16 
 
 
373 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  37.29 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  38.44 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  33.8 
 
 
371 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  37.63 
 
 
378 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  37.57 
 
 
365 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  34.13 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  36.64 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  34.22 
 
 
386 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  35.04 
 
 
394 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  35.81 
 
 
372 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  35.4 
 
 
374 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  36.02 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  34.35 
 
 
375 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  36.12 
 
 
365 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  33.81 
 
 
374 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  35.47 
 
 
427 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.78 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  34.56 
 
 
363 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  29.92 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  32.17 
 
 
429 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  29.3 
 
 
364 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  27.47 
 
 
360 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
380 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  27.89 
 
 
368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.4 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  27.79 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  30.47 
 
 
409 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.53 
 
 
478 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  24.44 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.2 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.57 
 
 
375 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
377 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
380 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
354 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  27.64 
 
 
375 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
375 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  28.42 
 
 
517 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.15 
 
 
354 aa  99.4  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
429 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  28.61 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
362 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  29.68 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
378 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  25.55 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.39 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.28 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  27.12 
 
 
372 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
372 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  28.01 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.72 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  23.98 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  24.79 
 
 
375 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.6 
 
 
365 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.86 
 
 
354 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
352 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.46 
 
 
354 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  24.71 
 
 
390 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  25.57 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  26.39 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  24.86 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  27.53 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.04 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.67 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  23.71 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  28.29 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  28.13 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  23.82 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  26.7 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.18 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>