More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0444 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  100 
 
 		 356 aa  723    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  76.49 
 
 		 372 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  64.45 
 
 		 361 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  47.18 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  36.95 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  34.51 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  34.44 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  34.44 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  30.73 
 
 		 354 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.95 
 
 		 483 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  31.43 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.79 
 
 		 478 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  34.87 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 380 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  28.27 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 402 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30.62 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.21 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.04 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.06 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.67 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 682 aa  90.5  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.42 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.42 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.56 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  27.3 
 
 		 517 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.21 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 682 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  23.67 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.07 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  24.59 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.26 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.46 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.21 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  26.69 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.53 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  22.61 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  23.97 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  25 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.17 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  23.88 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.94 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.54 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  25.63 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  22.93 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  23.06 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>