60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2340 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  238  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  34.11 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  41.41 
 
 		 608 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.53 
 
 		 597 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 576 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  37.17 
 
 		 725 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  33.33 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.04 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  39.02 
 
 		 599 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  33.05 
 
 		 517 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  35.71 
 
 		 603 aa  60.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.48 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  31.4 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  35.58 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  38.36 
 
 		 605 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.65 
 
 		 609 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  29.55 
 
 		 1005 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.11 
 
 		 584 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0617  FMN-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  29.36 
 
 		 582 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  35.14 
 
 		 623 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  29.82 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  38.1 
 
 		 702 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.4 
 
 		 616 aa  52.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.71 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.93 
 
 		 582 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  30.84 
 
 		 586 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  31.13 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  33.71 
 
 		 626 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  31.71 
 
 		 582 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  31.71 
 
 		 582 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  31.71 
 
 		 582 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.71 
 
 		 603 aa  50.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0490  hypothetical protein  32.58 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2602  FMN-binding domain protein  34.09 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.73 
 
 		 631 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  31.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  31.15 
 
 		 591 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  26.14 
 
 		 1004 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.74 
 
 		 577 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  28.92 
 
 		 715 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  29.91 
 
 		 586 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 598 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1030  FMN-binding domain protein  29.46 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0796  FMN-binding domain protein  29.46 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04000  FMN-binding domain protein  30.12 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000143856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.8 
 
 		 597 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.86 
 
 		 616 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  29.41 
 
 		 657 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.89 
 
 		 628 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1780  FMN-binding domain protein  30.34 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0196  FMN-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000126758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3782  FMN-binding domain protein  35.14 
 
 		 715 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  21.71 
 
 		 201 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6145  FMN-binding domain protein  28.05 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.0358485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1419  hypothetical protein  23.58 
 
 		 450 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.59 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  27.59 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  27.59 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  27.59 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>