20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6145 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6145  FMN-binding domain protein  100 
 
 
185 aa  357  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.0358485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0050  FMN-binding domain-containing protein  42.55 
 
 
188 aa  121  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0232  FMN-binding  50.36 
 
 
172 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6590  FMN-binding domain-containing protein  56.47 
 
 
160 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155769  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0490  hypothetical protein  42.53 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0391  FMN-binding domain protein  41.11 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.550009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3725  FMN-binding domain protein  43.04 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3923  FMN-binding domain-containing protein  41.25 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1300  FMN-binding domain protein  34.88 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.54 
 
 
640 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  35.53 
 
 
126 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.43 
 
 
580 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  32.91 
 
 
650 aa  45.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.33 
 
 
616 aa  45.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  28.23 
 
 
138 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  34.92 
 
 
702 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.75 
 
 
603 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.21 
 
 
597 aa  42.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  25.86 
 
 
609 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  34.62 
 
 
715 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>