18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6590 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6590  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  309  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155769  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0232  FMN-binding  55.88 
 
 
172 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6145  FMN-binding domain protein  58.24 
 
 
185 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.0358485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0050  FMN-binding domain-containing protein  49.04 
 
 
188 aa  95.5  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3725  FMN-binding domain protein  47.67 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3923  FMN-binding domain-containing protein  46.99 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0391  FMN-binding domain protein  45.45 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.550009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0381  FMN-binding domain protein  45.45 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0490  hypothetical protein  35.63 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1300  FMN-binding domain protein  35.29 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1780  FMN-binding domain protein  31.19 
 
 
127 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.31 
 
 
597 aa  47.4  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  34.31 
 
 
623 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14850  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000151684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.03 
 
 
580 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  30.38 
 
 
603 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2602  FMN-binding domain protein  27.7 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  35.06 
 
 
1004 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>