15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0232 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0232  FMN-binding  100 
 
 
172 aa  337  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6590  FMN-binding domain-containing protein  55.88 
 
 
160 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6145  FMN-binding domain protein  60.87 
 
 
185 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.0358485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3725  FMN-binding domain protein  50 
 
 
190 aa  89  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0050  FMN-binding domain-containing protein  45.63 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3923  FMN-binding domain-containing protein  47.56 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0381  FMN-binding domain protein  46.59 
 
 
135 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0391  FMN-binding domain protein  42.53 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.550009 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1300  FMN-binding domain protein  37.21 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.58 
 
 
580 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.94 
 
 
603 aa  45.1  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  33.9 
 
 
623 aa  44.3  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.46 
 
 
597 aa  42.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2602  FMN-binding domain protein  33.77 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>