18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0391 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0391  FMN-binding domain protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.550009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0050  FMN-binding domain-containing protein  49.48 
 
 
188 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3725  FMN-binding domain protein  50.6 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3923  FMN-binding domain-containing protein  50 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6145  FMN-binding domain protein  42.35 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.0358485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6590  FMN-binding domain-containing protein  43.21 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155769  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0232  FMN-binding  40 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0490  hypothetical protein  34.12 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1300  FMN-binding domain protein  35.29 
 
 
155 aa  48.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0381  FMN-binding domain protein  44.16 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1394  FMN-binding domain protein  26.92 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.89 
 
 
584 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  33.33 
 
 
582 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  33.33 
 
 
582 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  33.33 
 
 
582 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  33.33 
 
 
582 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  33.33 
 
 
608 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.05 
 
 
582 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>